Papatya çayının, sağlık için oldukça geniş bir kullanım alanı vardır. Bir çok rahatsızlığa iyi geldiği ve tedavi amacıyla kullanıldığı bilinir. Hoş bir kokusu olması sebebiyle sıkça yeşil çay olarak tüketilmektedir. Sinüzite karşı etkili maddelere sahiptir, mide bulantısı ve gaz sancıları gibi rahatsızlıklarda mideyi rahatlatır sancıları dindirir. Özellikle regl dönemlerinde sancıları yatıştırır. Uyku problemleri ve kas sancıları gibi rahatsızlıklarda tedavi edici özelliği vardır, zamanla uyku kalitesini arttırır. Yemeklerle birlikte tüketildiğinde kan şekerini düzenleyici etkisi vardır. Papatya çayı içeriğindeki antioksidanlar sayesinde kandaki kolesterolü ve kan basıncının kontrol edilmesinde katkıda bulunur.